AI har skapat ett virus som naturen inte har skapat tidigare. Det är (för det mesta) goda nyheter

Ett team av forskare från Stanford och Arc Institute har använt Evo 1 och Evo 2 genomiska modeller för att konstruera kompletta genom av bakteriofager, det vill säga virus som infekterar bakterier. De ansvariga för experimentet syntetiserade 285 av dessa mönster, och 16 av dem fungerade: de kunde sprida sig, attackera specifika stammar av E. coli och förstöra dem. De är inte virus som kan infektera människor, djur eller växter.

Nyheten är överraskande: dessa modeller lyckades skapa funktionella virala genom som – så vitt vi vet – inte tidigare fanns i naturen. Från att läsa DNA till att skriva det. Evo arbetar med en idé som liknar den för stora språkmodeller, men istället för att generera bilder eller text vad den förstår är nukleotider.

Den lär sig mönster genom att tränas med enorma samlingar av genetiska sekvenser och genererar sedan nya kombinationer som kan vara vettiga. Den produktionen kan teoretiskt syntetiseras kemiskt, införas i en cell och testas för att se om den ger upphov till ett funktionellt biologiskt system. I Xataka Alla dessa superdåliga bakterier lever i din kropp (och ingenting händer) Endast 16 fungerade, men det spelar stor roll.

Av de 285 genom som syntetiserades var 269 inte livskraftiga. Det betyder att AI är långt ifrån att förvandla någon "prompt" till en funktionell organism första gången. Men de återstående 5,6% - 16 genom - visar att modellen har förstått tillräckligt med biologiska begränsningar för att producera kandidater som klarar av att överleva utanför datorsimuleringen.

Forskarna upptäckte också att en del av dem konkurrerade bättre än det naturliga virus som användes som referens, och att man genom att kombinera flera av dem kunde övervinna resistensen som förvärvats av flera stammar av E. coli. Virus som aldrig setts i naturen. Vart och ett av de 16 funktionella virusen innehöll mellan 67 och 392 mutationer med avseende på sin närmaste naturliga släkting.

Tretton inkluderade mutationer som forskarna inte hittade i några kända naturliga sekvenser. En av dem, Evo-Φ2147, var så långt borta från sin närmaste släkting att den kunde klassificeras som en ny art under vissa taxonomiska kriterier. Även om vi inte kan säga att en identisk sekvens någonsin har funnits på jorden, vad vi vet är att den inte förekommer i något av de kända naturliga genomen.

Evolutionen fortsätter att sätta gränser. Ytterligare analys avslöjade att dessa AI-genererade virus förblir fylogenetiskt nära andra kända virus, och mycket av deras effektivitet kommer från att vistas inom kända och fungerande regioner av genetiskt utrymme. Således är Evo mer av en evolutionär optimerare än en maskin som kan skapa liv från ingenting, något som utan tvekan minskar potentiella röda flaggor och risker.

Målet: döda bakterier. Bakteriofager angriper bakterier på ett mycket specifikt sätt och har studerats i decennier som ett alternativ eller komplement till antibiotika. Och eftersom vissa bakterier utvecklar resistens mot tillgängliga läkemedel blir den här typen av projekt ännu mer intressanta.

De 16 designade fagerna visade ett begränsat värdområde, särskilt för E. coli C och en besläktad stam, och forskarna föreslår just fagterapi som en framtida tillämpning. Löftet är att vi inte ska behöva leta efter lämpliga virus i naturen så att vi kan designa dem för att attackera specifika bakterier.

Den andra sidan av myntet. Dessa experiment utfördes med en gafo med bara 11 gener som inte infekterar människor och valdes just för den säkerheten.

En nyligen genomförd biosäkerhetsanalys drog slutsatsen att de nuvarande funktionerna hos Evo 2 ger en låg till måttlig oro för att skapa nya biologiska hot, särskilt eftersom designen som skapas ligger nära de som fungerar som referens. Frågan är vad som kommer att hända när framtida modeller kan designa mer komplexa genom. I Xataka | Från att orsaka diarré till att tillverka biologiskt nedbrytbar plast: bakterierna E. coli har ett nytt jobb i Japan